Sökning: "in situ sekvensering"

Hittade 2 uppsatser innehållade orden in situ sekvensering.

  1. 1. Machine learning for blob detection in high-resolution 3D microscopy images

    Master-uppsats, KTH/Skolan för elektroteknik och datavetenskap (EECS)

    Författare :Martin Ter Haak; [2018]
    Nyckelord :Biomedical Image Analysis; Blob Detection; Machine Learning; 3D; Computer Vision; Image Processing; Biomedicinsk bildanalys; Blobdetektion; Maskininlärning; 3D; Datorseende; Bildbehandling;

    Sammanfattning : The aim of blob detection is to find regions in a digital image that differ from their surroundings with respect to properties like intensity or shape. Bio-image analysis is a common application where blobs can denote regions of interest that have been stained with a fluorescent dye. LÄS MER

  3. 2. Ett sannolikhetsbaserat kvalitetsmått förbättrar klassificeringen av oförväntade sekvenser i in situ sekvensering

    Kandidat-uppsats, Uppsala universitet/Institutionen för biologisk grundutbildning

    Författare :Olle Nordesjö; Victor Pontén; Stephanie Herman; Joel Ås; Sabri Jamal; Alona Nyberg; [2014]
    Nyckelord :fluorescence in situ sequencing; quality assurance; image analysis; signal processing; bioinformatics; molecular inversion probe; padlock probe; in situ sekvensering; kvalitetskontroll; bildanalys; signalbehandling; bioinformatik; padlock probe; molekylär inversionsprob;

    Sammanfattning : In situ sekvensering är en metod som kan användas för att lokalisera differentiellt uttryck av mRNA direkt i vävnadssnitt, vilket kan ge viktiga ledtrådar om många sjukdomstillstånd. Idag förloras många av sekvenserna från in situ sekvensering på grund av det kvalitetsmått man använder för att säkerställa att sekvenser är korrekta. LÄS MER