Sökning: "Protein structure determination"

Visar resultat 1 - 5 av 20 uppsatser innehållade orden Protein structure determination.

  1. 1. Determination of Proton Beam Waist Positions Using Beam Position Monitors

    Kandidat-uppsats, Lunds universitet/Fysiska institutionen; Lunds universitet/European Spallation Source ESS AB; Lunds universitet/Synkrotronljusfysik

    Författare :Gustav Gird Fahlström; [2022]
    Nyckelord :ESS; European Spallation Source; Proton beam; waist; BPM; Method; transverse; beam dynamics; beam physics; Lattice Error; Matrix formalism; Python; trajectory simulation; physics; Physics and Astronomy;

    Sammanfattning : In this work, we examine a novel method for the determination of proton beam waist locations using beam position monitors. Based on the lattice of the final transport line section of the European Spallation Source linac, a simplified version of the beam line composed of quadrupole magnets and correctors is constructed in Python using a matrix formalism. LÄS MER

  3. 2. Engineered imaging scaffolds for cryo-EM of small proteins of interest

    Master-uppsats, KTH/Proteinvetenskap

    Författare :Oscar Friberg; [2022]
    Nyckelord :Protein structure determination; single-particle cryo-EM; imaging scaffold; size limitation problem; affibody; YgjG.;

    Sammanfattning : Strukturbestämning av proteiner är viktigt för att kunna förstå deras funktion och en snabbt utvecklande metod inom fältet är kryoelektronmikroskopi. Storleksbegränsningar förhindrar en bredare applikation av metoden eftersom små proteiner har för låg signal i förhållande till bakgrund för att kunna visualiseras som enstaka partiklar i elektronmiksoskopibilder. LÄS MER

  4. 3. Crystallization, optimization, and crystal structure determination of ligands in complex with galectin-8N

    Kandidat-uppsats, Lunds universitet/Kemiska institutionen

    Författare :George Larsson; [2022]
    Nyckelord :Biochemistry; Structural Biochemistry; Galectin-8; Protein Crystallization; Chemistry;

    Sammanfattning : This thesis focuses on the protein “galectin-8N” which is a lectin protein that takes part in several physiological functions such as inflammation, autophagy, cell migration, and more. The project has three objectives: to observe and increase the reproducibility of crystallization of two variants (wildtype and mutant) of the human protein galectin-8N and to analyze the binding site when three different novel ligands are each inserted. LÄS MER

  5. 4. Reducerad aggregering av affibodymolekyler

    Kandidat-uppsats, KTH/Medicinteknik och hälsosystem

    Författare :Josefin Rehn Hamrin; Nina Gyllenhoff; [2022]
    Nyckelord :Affibody; solubility; precipitation; aggregation prone; concentration determination; Affibody; löslighet; aggregerande protein; koncentrationsbestämning;

    Sammanfattning : I dagsläget utvecklas ständigt nya läkemedel med hjälp av affinitetsprotein. På 90-talet skapades ett nytt sådant protein utvunnet från Protein A på KTH, den så kallade affibodyn. Att arbeta med affibodies är ofta fördelaktigt eftersom de är lätta producera samtidigt som de delar många av de väsentliga egenskaperna hos en antikropp. LÄS MER

  7. 5. Structure-based design of new antiviral substances against the Venezuelan equine encephalitis virus

    Master-uppsats, Lunds universitet/Tillämpad biokemi; Lunds universitet/Beräkningskemi

    Författare :Elin Öberg; [2022]
    Nyckelord :x-ray crystallography; protein crystallization; Venezuelan equine encephalitis virus; structure-based drug design; applied biochemistry; Technology and Engineering;

    Sammanfattning : The Venezuelan equine encephalitis virus (VEEV) is a highly infectious alphavirus responsible for severe outbreaks and epidemics in the Americas. The nonstructural protein 2 (nsP2) cysteine protease plays a fundamental role in the VEEV replication process, and is therefore, an attractive drug target for structure-based drug design using x-ray crystallography. LÄS MER