Sökning: "Regulatory gene network"

Visar resultat 1 - 5 av 23 uppsatser innehållade orden Regulatory gene network.

  1. 1. Autoencoder-Based Likelihood-Free Parameter Inference of Gene Regulatory Network

    Master-uppsats, Uppsala universitet/Institutionen för informationsteknologi

    Författare :Liang Cheng; [2023]
    Nyckelord :;

    Sammanfattning : Likelihood-free parameter inference is a well-known statistical methodology that estimates the posterior distribution of model parameters even in cases where the likelihood function is intractable. The performance of this method is highly correlated with the learning of summary statistics, which capture the key features from the high dimensional data such as time series. LÄS MER

  3. 2. Inferring Gene regulatory networks using Graph Neural Networks

    Master-uppsats, KTH/Genteknologi

    Författare :Sohta Makino; [2023]
    Nyckelord :Graph Attention Network; Gene regulatory Network; Transcription; Data Science; Machine learning; Genreglering; transkription; dataanalys; Inferens; maskininlärning;

    Sammanfattning : Inom beräkningsbiologin är det snabbt på väg att bli allt vanligare att ta fram genetiska regleringsnätverk (GRN). På grund av storleken på de undersökta nätverken använder många forskare maskininlärning för att härleda GRN från genuttrycksdata, vanligtvis från RNA-seq. LÄS MER

  4. 3. Hic2 overexpression increase of cell reprogramming efficiency- a computational study

    Kandidat-uppsats, Lunds universitet/Fysiska institutionen; Lunds universitet/Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Genomgår omorganisation

    Författare :Paulina Ibek; [2023]
    Nyckelord :Physics and Astronomy;

    Sammanfattning : Since stem cells have many applications in medicine and can be used for treating e.g. cancer and diabetes, finding efficient methods for producing them is a relevant area of research. LÄS MER

  5. 4. Capturing genes with high impact based on reconstruction errors produced by variational autoencoders

    Master-uppsats, Högskolan i Skövde/Institutionen för biovetenskap

    Författare :Utz Lovis Rieger; [2023]
    Nyckelord :;

    Sammanfattning : In this work we present a novel method to extract potential hub genes, transcription factors and regions with densely interconnected protein-protein-interaction networks from RNAseq data. To achieve this we deploy variational autoencoders, a generative machine learning framework, and extract the gene-wise reconstruction errors. LÄS MER

  7. 5. Comprehensive Analysis of lncRNA and circRNA Mediated ceRNA network in Psoriasis

    Magister-uppsats, Högskolan i Skövde/Institutionen för biovetenskap

    Författare :Saima Imran; [2022]
    Nyckelord :;

    Sammanfattning : Evidence is accumulating that noncoding RNAs and circRNA are involved in psoriasis; however, the competing endogenous RNA (ceRNA) mediated regulatory mechanisms in psoriasis are rarely reported. The research study aimed to comprehensively investigate the differences in the expression levels of circular RNA (circRNA), long non-coding RNA (lncRNA), microRNA (miRNA/miR), and mRNA in psoriasis. LÄS MER