Sökning: "fluorescence in situ sequencing"

Hittade 3 uppsatser innehållade orden fluorescence in situ sequencing.

  1. 1. Ovary spheroid formation and quality assessment using two different protocols

    Master-uppsats, KTH/Proteinvetenskap

    Författare :Nikki Wallius Hiltunen; [2023]
    Nyckelord :ovary; fertility; spheroid; Biosilk™; three-layer gradient system; äggstock; fertilitet; sfäroid; Biosilk™; trelagers gradientsystem;

    Sammanfattning : Redan innan födseln fastställs kvinnors fertilitet, som karakteriseras av ett begränsat antal äggblåsor, så kallade folliklar. Beståndet av folliklar minskar naturligt med åldern, samtidigt som kvinnors fertilitet beror på deras steroid- och äggproduktion. LÄS MER

  3. 2. Developing Automated Cell Segmentation Models Intended for MERFISH Analysis of the Cardiac Tissue by Deploying Supervised Machine Learning Algorithms

    Master-uppsats, KTH/Kemi

    Författare :Julia Rune; [2023]
    Nyckelord :Cell Segmentation; Cellpose; Supervised Machine Learning; MERFISH; Heart Failure; Cellsegmentering; Cellpose; Övervakad Maskininlärning; MERFISH; Hjärtsvikt;

    Sammanfattning : Följande studie behandlar utvecklandet av automatiserade cellsegmenteringsmodeller med avsikt att identifiera gränser mellan celler i hjärtvävnad. Syftet är att möjliggöra analys av data genererad från multiplexed error-robust in situ hybridization (MERFISH). LÄS MER

  4. 3. Ett sannolikhetsbaserat kvalitetsmått förbättrar klassificeringen av oförväntade sekvenser i in situ sekvensering

    Kandidat-uppsats, Uppsala universitet/Institutionen för biologisk grundutbildning

    Författare :Olle Nordesjö; Victor Pontén; Stephanie Herman; Joel Ås; Sabri Jamal; Alona Nyberg; [2014]
    Nyckelord :fluorescence in situ sequencing; quality assurance; image analysis; signal processing; bioinformatics; molecular inversion probe; padlock probe; in situ sekvensering; kvalitetskontroll; bildanalys; signalbehandling; bioinformatik; padlock probe; molekylär inversionsprob;

    Sammanfattning : In situ sekvensering är en metod som kan användas för att lokalisera differentiellt uttryck av mRNA direkt i vävnadssnitt, vilket kan ge viktiga ledtrådar om många sjukdomstillstånd. Idag förloras många av sekvenserna från in situ sekvensering på grund av det kvalitetsmått man använder för att säkerställa att sekvenser är korrekta. LÄS MER