Sökning: "high-throughput sequencing"

Visar resultat 1 - 5 av 32 uppsatser innehållade orden high-throughput sequencing.

  1. 1. Estimating Variant Intolerance for Genes of Cattle

    Master-uppsats, SLU/Dept. of Animal Breeding and Genetics

    Författare :Simon Lanigan; [2024]
    Nyckelord :Genes; Cattle;

    Sammanfattning : Cattle play a crucial role in providing nutrition and economic stability worldwide. Threats to their health, particularly infectious diseases, and genetic mutations, can have profound implications for both animal and human livelihoods. LÄS MER

  3. 2. Foliar fungal communities of naturally regenerated and nursery-produced Scots pine (Pinus sylvestris) seedlings

    Uppsats för yrkesexamina på avancerad nivå, SLU/Dept. of Forest Mycology and Plant Pathology

    Författare :Sara López Fernández; [2023]
    Nyckelord :Endophytes; high-throughput sequencing; foliar fungi; forest nursery; fungal community; fungal pathogens; metabarcoding; mycobiome; Pinus sylvestris; pine seedlings; Scots pine needles;

    Sammanfattning : Endophytic fungal communities living in leaves of trees can have a significant impact on their hosts,showing both beneficial and detrimental effects. Some mutualistic fungal species protect the host against pathogens or herbivores, while pathogenic species can increase the vulnerability of the host against biotic and abiotic stresses. LÄS MER

  4. 3. Benchmarking of computational methods for Spatial Transcriptomics Data analysis

    Master-uppsats, KTH/Proteinvetenskap

    Författare :Nima Taherpour; [2022]
    Nyckelord :Spatial Transcriptomics; Scanpy; Squidpy; Giotto; Seurat;

    Sammanfattning : Ökningen av sekvenseringsdata har skapat ett behov av att ta fram nya och flexibla analysmetoder för att kunna analysera datan. Många sekvenseringsteknologier har utvecklats genom åren, med olika syften och de är idag mer specialiserade. LÄS MER

  5. 4. Pipeline for Next Generation Sequencing data of phage displayed libraries to support affinity ligand discovery

    Uppsats för yrkesexamina på avancerad nivå, Uppsala universitet/Institutionen för immunologi, genetik och patologi

    Författare :Ella Schleimann-Jensen; [2022]
    Nyckelord :NGS; next generation sequencing; phage display; affinity ligands; data analysis; bioinformatics;

    Sammanfattning : Affinity ligands are important molecules used in affinity chromatography for purification of significant substances from complex mixtures. To find affinity ligands specific to important target molecules could be a challenging process. Cytiva uses the powerful phage display technique to find new promising affinity ligands. LÄS MER

  7. 5. Analysing Non-Desired Output Data from High Throughput Sequencers for the Identification of the Source of Contamination

    Master-uppsats, KTH/Proteinvetenskap

    Författare :Mayra Guadalupe Martinez Maldonado; [2022]
    Nyckelord :high-throughput sequencing; metagenomics; MGI; contamination; molecular barcode; högkapacitetssekvensering; metagenomik; MGI; kontaminering; DNA-streckkod;

    Sammanfattning : High-throughput Sequencing (HTS)-tekniker fortsätter att utvecklas snabbt, vilket ökar genomströmningen och minskar sannolikheten för fel. MGI Tech Co., Ltd. (MGI) är ett ledande HTS-varumärke som använder DNBSEQ-teknologi och finns i Center for Translational Microbiome (CTMR). LÄS MER