Sökning: "next generation sequencing NGS"

Visar resultat 1 - 5 av 31 uppsatser innehållade orden next generation sequencing NGS.

  1. 1. Multiple-Emitter Super-resolution Imaging using the Alternating Descent Conditional Gradient Method

    Kandidat-uppsats, Lunds universitet/Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Genomgår omorganisation; Lunds universitet/Institutionen för astronomi och teoretisk fysik - Genomgår omorganisation

    Författare :Dolev Illouz; [2023]
    Nyckelord :super-resolution; alternating descent conditional gradient method; ADCG; multiple-emitter localization; nanoscale imaging; single molecule tracking; Physics and Astronomy;

    Sammanfattning : This thesis examines the state-of-the-art 2D super-resolution technique alternating descent conditional gradient (ADCG) method's ability to accurately localize fluorophores in diffraction-limited single molecule images (SMI) and analyze the impact of pre-processing and post-processing modules on ADCG's fluorophore localization. A synthetic dataset obtained from the 2013 Grand Challenge localization microscopy and a temporally linked dataset obtained from an unpublished set of Optical DNA mapping experiments performed by Jonathan Jeffet at the NanoBioPhotonix Lab at Tel-Aviv University were initially segmented to extract their noise parameters. LÄS MER

  3. 2. PAMPaR: Parallel Analysis of miRNAs, Proteins and RNAs. Dynamic Profiles of miRNAs, mRNAs and Specific Proteins in Mouse Embryonic Stem Cells Differentiating into Neural Precursors

    Master-uppsats, KTH/Proteinvetenskap

    Författare :Amelie Carlström; [2023]
    Nyckelord :PAMPaR; SPARC; Proximity extension assay; Neuronal differentiation; Mouse embryonic stem cells; PAMPaR; SPARC; Proximity extension assay; Neuronal differentiering; embryonala musstamceller;

    Sammanfattning : MikroRNA-molekyler (miRNA) är viktiga icke-kodande RNA-molekyler för post-transkriptionell reglering av proteinkodande gener. De har även effekter på många cellulära processer såsom differentiering. De biosyntetiska reaktioner som skapar miRNA involverar proteiner som själva regleras av miRNA. LÄS MER

  4. 3. Vilken ny kunskap ger aDNA-analyser om vegetationsutvecklingen i Nordeuropa under och efter Weichsel-istiden?

    Kandidat-uppsats, Lunds universitet/Geologiska institutionen

    Författare :Beatrix Cordes; [2023]
    Nyckelord :aDNA; ancient DNA; vegetationshistoria; vegetationsförändring; PCR; NGS; Nordeuropa; next generation sequencing; Weichselistiden; Earth and Environmental Sciences;

    Sammanfattning : Under de senaste 30 åren har en ny metod för att få information om tidigare ekosystem utveck- lats, nämligen att analysera gammalt (“ancient”) DNA (aDNA). Denna forskningsgren är fortfarande ung men har redan hittat många områden inom vilka den kan tillämpas. LÄS MER

  5. 4. Development of a simplified and cost effective norovirus capsid typing method using next generation sequencing

    Magister-uppsats,

    Författare :Ronnie Eriksson; [2023]
    Nyckelord :PCR; Foodborne virus; Food safety; Illumina; NGS;

    Sammanfattning : Human noroviruses are a major cause of acute gastroenteritis worldwide and can betransmitted through consumption of contaminated raw food. Shellfish like oysters can becontaminated by human sewage during production and accumulate multiple Norovirus strainsin low concentrations. LÄS MER

  7. 5. A Rank Score Model of Variants Prioritization for Rare Disease

    Master-uppsats, Uppsala universitet/Institutionen för biologisk grundutbildning

    Författare :Nanxing Liu; [2023]
    Nyckelord :machine learning; variants; rare disease;

    Sammanfattning : The diagnosis of genetic illnesses has undergone a revolution with advancements in sequencing technology. Next-generation sequencing (NGS) has become a standard practice in genetic diagnostics, enabling the identification of various genetic variations. LÄS MER