Etablering av MALDI-TOF MS och webbaserad referensdatabas för identifiering av dermatofyter och mögelsvamp

Sammanfattning: Syftet med studien var att etablera Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry(MALDI-TOF MS) och onlinedatabasen Mass Spectrometry identification platform(MSI) som metod för identifiering av dermatofyter och mögelsvamp. Svamparna inkuberades 3 eller 6 dagar aerobt i 30°C på Sabouraud dextros agar. Två olika extraktionsmetoder användes innan analys med MALDI-TOF MS. Spektra analyserades med Flexcontrol version 3.4 och resulterade i scorevärde. De spektra som framkom skickades även till MSI för ytterligare analys där resultat erhölls som sannolikhet i procent. Av de ursprungliga 23 st prov identifierades totalt 22st(95,6%) efter 3 eller 6 dagars inkubation och med extraktionsmetod 1 eller 2. MSI databasen var mer omfattande än den interna databasen, men använde sig inte av de aktuella namnen. Behovet av artidentifiering kan ifrågasättas, då många dermatofyter och mögel inom samma släkte behandlas på samma sätt. Artbestämning för immunsupprimerade patienter kan däremot vara viktigt. Studien var lyckad och metoderna kommer tillämpas inom en snar framtid på Klinisk Mikrobiologi i Halmstad.