Simulerad effektivisering av genotypdataanalys genom poolade data

Detta är en Kandidat-uppsats från Uppsala universitet/Avdelningen för beräkningsvetenskap

Författare: Simon Strömstedt Hallberg; Jonas Giek; [2016]

Nyckelord: genotype; allele; optimization; microarray; 1000genomesproject; variantcontext; variantcall; vcf; genotyp; genotypdata; effektivisering; allele; microarray; 1000genomesproject; minor allele frequency; variantcontext; variantcall; vcf;

Sammanfattning: Målet med projektet är att undersöka om det går att effektivisera hur man undersöker människors gener. Detta görs genom att skapa ett program i Java. Resultatet är ett program som sorterar genotypdata från 1000 Genomes Project och utvärderar nyttan av att undersöka genotyper från flera individer samtidigt.

  HÄR KAN DU HÄMTA UPPSATSEN I FULLTEXT. (följ länken till nästa sida)