Phoma i skogsplantskolor : Fylogenetisk karakterisering av Phoma herbarum från svenska skogsplantor

Sammanfattning: Svenska forskare har märkt av en ökning bland Phoma infekterade skogsplantor från plantskolor runt om i landet. Både skott och rötter från tidigare undersökning har detekterats infekterade med svampar från släktet Phoma. Denna studie undersöker isolat av svamp tagna från rötter och skott på gran och tall från 9 olika plantskolor. Isolaten är identifierade utifrån morfologi och molekylär fylogeni utifrån ITS-sekvensen och tillhör släktet Phoma. Studiens syfte var att genom multilokusfylogeni med sekvenserna ITS, aktin och translation elongation factor 1-alpha, utvärdera om svamparna som infekterar rot respektive skott på plantorna tillhör samma eller olika arter av Phoma. Resultatet som presenteras i tre fylogenetiska träd, stödjer inte att isolaten tillhör olika arter. Vidare kunde två isolat konstatera tillhöra annat släkte och indikera morfologisk identifiering som otillräcklig för att särskilja olika arter inom Phoma-släktet.