Validering av vankomycin-resistenta enterokocker : Diagnostik på panther fusion open access instrument

Sammanfattning: Panther Fusion® system är ett fullständigt automatiserat in vitro diagnostiksystem som har högt flöde av prov-till-resultat och tillåter utförandet av in vitro diagnostiska tester genom användning av realtids Polymerase Chain Reaction (realtids-PCR). Syftet med detta projekt är att validera om det finns möjlighet att använda ett kit från Amplidiag på Panther fusion open access för att diagnostisera vankomycin resistenta enterokocker (VRE) samt att utvärdera analys direkt på E-swab prover istället för anrikningsbuljong. Det är viktigt att kunna detektera vanA-och vanB-generna i prover för att VRE hyser dessa gener. Sensitivitet och effektivitet av Panther fusion open access undersöktes genom att analysera proverna parallellt med Bio-Rad CFX384/96-PCR som är rutinmetoden för VRE-diagnostik på Klinisk mikrobiologi i Lund. Specificitet av en tidigare publicerad PCR-mix (PCR-mix) som kan detektera vanA och vanB i prover jämfördes med Amplidiag assay mix 2 som används i rutinmetoden. För att kunna utvärdera skillnaden av specificiteten och känsligheten mellan E-swab och anrikningsbuljong utfördes analysen på både E-swab och anrikningsbulong med både Panther fusion open access och Bio-Rad CFX384/96-PCR. MgCl2- koncentration optimerades till 3,0 mM. Sensitivitet och effektivitet av Panther fusion open access var högre med PCR-mix än Amplidiag assay mix 2 och uppvisade optimalt linjäritet. Specificitetstest av PCR-mixen visade att den bara kunde detektera vanA och vanB. Resultaten av spikade VRE-negativa patientprover (E-swab) visade sig vara orimliga då flera av proverna och kontrollerna gav resultat för båda generna. För att ersätta VRE-diagnostik på Bio-Rad CFX384/96 med Panther fusion open access behöver ytterligare experiment genomföras direkt på E-swab och vankomycine variabla enterokocker (VVE)-prover på Panther fusion open access.