Sökning: "smFISH"

Hittade 3 uppsatser innehållade ordet smFISH.

  1. 1. Studying gene expression scaling with cell size in Arabidopsis thaliana : the role of the nuclear RNA exosome complex

    Kandidat-uppsats, SLU/Dept. Of Plant Biology

    Författare :Emily Tåhlin; [2024]
    Nyckelord :RNA; transcription; cell size; smFISH; Arabidopsis thaliana;

    Sammanfattning : The scaling of organ size with body size - known as morphological allometry - is a fundamental mechanism observed in all organisms (Mirth et al. 2016). LÄS MER

  3. 2. Developing Automated Cell Segmentation Models Intended for MERFISH Analysis of the Cardiac Tissue by Deploying Supervised Machine Learning Algorithms

    Master-uppsats, KTH/Kemi

    Författare :Julia Rune; [2023]
    Nyckelord :Cell Segmentation; Cellpose; Supervised Machine Learning; MERFISH; Heart Failure; Cellsegmentering; Cellpose; Övervakad Maskininlärning; MERFISH; Hjärtsvikt;

    Sammanfattning : Följande studie behandlar utvecklandet av automatiserade cellsegmenteringsmodeller med avsikt att identifiera gränser mellan celler i hjärtvävnad. Syftet är att möjliggöra analys av data genererad från multiplexed error-robust in situ hybridization (MERFISH). LÄS MER

  4. 3. Quantification of DNA Microballs Using Image Processing Techniques

    Master-uppsats, KTH/Industriell bioteknologi

    Författare :Yosef Werede Tedros; [2023]
    Nyckelord :Spot detection; Deep learning; Image processing; smFISH; Gene editing; CRISPR; Rolling circle amplification; Big-FISH; LodeSTAR; DeepSpot; Detektering av punkter; Djupinlärning; Bildbehandling; smFISH; Genredigering; CRISPR; Rolling circle amplification; Big-FISH; LodeSTAR; DeepSpot;

    Sammanfattning : I detta examensarbete användes olika bildbehandlingstekniker för detektion och kvantifiering av DNA-mikrobollar, mer specifikt rolling circle amplification-produkter, på mikroskopibilder. Avsikten med detta arbete var att hjälpa Countagen AB utforska pipelines för bildbehandling för sin produkt där de analyserar utfallet av genredigeringsförsök på ett billigare och snabbare sätt än dagens konventionella sekvenseringsmetoder. LÄS MER